Он погиб 28 февраля в результате массированной комбинированной атаки вооруженных сил Израиля и США на его резиденцию в Тегеране. В стране объявлен общенациональный 40-дневный траур и семь дней выходных, а государственные телеканалы сменили сетку вещания, транслируя архивные кадры с черной траурной лентой.
Согласно конституции исламской республики, в случае смерти или недееспособности верховного лидера его функции временно переходят к специальному руководящему совету. В состав этого переходного органа вошли три ключевые фигуры: президент страны Масуд Пезешкиан, глава судебной власти и один из членов Совета стражей конституции. Этот триумвират будет обеспечивать управление государством до момента избрания нового лидера, за что отвечает Ассамблея экспертов (Совет экспертов).
Ситуация в регионе остается крайне напряженной на фоне заявлений Корпуса стражей исламской революции (КСИР) о неминуемом возмездии. Иранские власти сообщили, что вместе с 86-летним аятоллой под обстрел попали и другие высокопоставленные чиновники, а также члены его семьи. В ответ на ликвидацию своего лидера Тегеран уже инициировал пуски баллистических ракет и беспилотников в сторону Израиля и американских военных баз на Ближнем Востоке.